Xét nghiệm HP bằng hơi thở (còn gọi là test hơi thở Ure hoặc test hơi thở C13) là kỹ thuật không xâm lấn (non-invasive), dựa trên nguyên tắc là người bệnh sẽ được uống 1 viên thuốc hoặc 1 dung dịch có chứa Ure gắn phân tử Carbon đồng vị C13. Nếu có HP trong dạ dày thì vi khuẩn HP sẽ tạo ra men urease và thủy phân Ure trong thuốc uống vào thành Amoniac và khí Cacbonic. Khí Cacbonic với phân tử C13 này được hấp thu vào máu và đào thải qua phổi. Người ta sẽ đo lượng C13 thải ra trong hơi thở của người thử, từ đó xác định được vi khuẩn HP có hoạt động (sinh ra urease) trong dạ dày không.

Kết quả phát hiện nhiễm vi khuẩn HP được đánh giá theo số đếm nhấp nháy trong một phút (cpm: counts per minute) như sau:

• Giá trị từ 0 – <25 cpm là (-) tính: bệnh nhân hiện không bị nhiễm H.pylori.
• Giá trị từ 25-<50 cpm là không xác định.
• Giá trị > 50 cpm là (+) tính: bệnh nhân đang bị nhiễm H. pylori.

Xét nghiệm HP hơi thở có 2 loại là: Sử dụng Carbon 13 (C13) hoặc sử dụng Carbon 14 (C14). Tại Khoa Xét Nghiệm BUH đang triển khai xét nghiệm HP bằng C13 với những ưu điểm như sau: Có độ nhạy và chính xác tương đương với C14. Phương pháp này không có chất phóng xạ nên an toàn cho tất cả mọi người, kể cả trẻ em dưới 8 tuổi và phụ nữ đang mang thai, tuy nhiên giá thành cao hơn nhiều so với sử dụng C14.